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Polimorfismi genetici mediante ALU PCR |
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Prerequisiti
Struttura del DNA, funzione della DNA polimerasi. Obiettivi formativi
Conoscere e sperimentare le principali tecniche di biologia molecolare quali: estrazione, amplificazione, separazione e confronto di sequenze di DNA. Descrizione
L'esperimento intende individuare la presenza sul Locus PV92 del cromosoma 16 dell'elemento trasponibile Alu, ovvero di una particolare sequenza di DNA che si "riproduce" copiando se stessa e si inserisce in nuove ubicazioni cromosomiche.
Dopo aver isolato il proprio DNA dalla mucosa boccale, verrà amplificata, tramite la reazione a catena della polimerasi (PCR) una specifica sequenza che avrà lunghezza diversa a seconda che la sequenza Alu si sia integrata o meno nel Locus PV92 del cromosoma 16.
Alu può essere presente (allele +) o assente (allele -) in entrambi i membri della coppia cromosomica o presente in uno e assente in quello omologo. Dunque, in un individuo, le possibili combinazioni genotipiche di questi due alleli sono tre: ++, +-, --.
Le sequenze di DNA amplificate verranno visualizzate attraverso l'elettroforesi su gel, tecnica che separa i frammenti di DNA in base al loro peso molecolare, e dunque in base alle loro dimensioni.  Conclusioni
Poiché i campioni che vengono utilizzati per la PCR sono prelevati dai singoli studenti, si può evidenziare la frequenza genotipica di Alu PV92 all'interno della classe (dall'analisi dei gel è possibile, infatti, osservare se ciascun individuo è omozigote ++, -- o eterozigote) e confrontare il risultato con quelli di gruppi di nazionalità diverse mediante l'utilizzo di specifiche banche dati e ricostruire in piccolo un esperimento di genetica delle popolazioni.
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Protocolli 
